Anitra Steen inledde sin yrkesbana som socialassistent i Nacka samt utredare vid Försäkringskassan och RFV. 1981 anställdes hon vid finansdepartementet, där hon blev departementsråd 1985. Hon var statssekreterare i utbildningsdepartementet 1989-91 samt i finansdepartementet 1994-95. Vidare har hon varit generaldirektör för två statliga verk: Verket för högskoleservice 1992-94 och Riksskatteverket 1996-99. Mellan 1999 och 2009 var hon VD för Systembolaget AB. Systembolaget moderniserades och omvandlades under den tiden att bli mer lik en detaljhandel med bland annat självbetjäning och hon var chef under muthärvan 2003 då bland annat 65 butikschefer fälldes.